Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSLPQ969D9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSLPQ969D9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms