Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRUQ92729 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms