Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms