Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms