Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms