Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms