Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms