Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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