Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS1Q86UR5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMS1Q86UR5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms