Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms