Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms