Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms