Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms