Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZRN4Q6ZMN7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms