Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms