Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms