Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms