Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGMBQ6NW40 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms