Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RWDD4Q6NW29 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RWDD4Q6NW29 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms