Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms