Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL2Q6F5E8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms