Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L3Q68CJ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms