Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP135Q66GS9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms