Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms