Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND3Q5T5X7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms