Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms