Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms