Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms