Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GREB1Q4ZG55 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GREB1Q4ZG55 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms