Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms