Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms