Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK2Q16620 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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