Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GABRA6Q16445 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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