Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SF1Q15637 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms