Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ELOBQ15370 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms