Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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