Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PCM1Q15154 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PCM1Q15154 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PCM1Q15154 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PCM1Q15154 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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