Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
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