Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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