Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHPRHQ149N8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHPRHQ149N8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
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