Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC3Q14574 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC3Q14574 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms