Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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COL4A6Q14031 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL4A6Q14031 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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