Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms