Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms