Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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