Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCGQ13326 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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