Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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