Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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