Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms