Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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